MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 plasmid pTW20_1

Total Repeats: 722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017352	TCCG	2	8	80	87	0 %	25 %	25 %	50 %	387144421
2	NC_017352	CGG	2	6	137	142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387144421
3	NC_017352	TGA	2	6	204	209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144421
4	NC_017352	GTC	2	6	220	225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387144421
5	NC_017352	C	6	6	251	256	0 %	0 %	0 %	100 %	387144421
6	NC_017352	AC	3	6	305	310	50 %	0 %	0 %	50 %	387144421
7	NC_017352	GTCC	2	8	375	382	0 %	25 %	25 %	50 %	387144421
8	NC_017352	TCGGT	2	10	466	475	0 %	40 %	40 %	20 %	387144421
9	NC_017352	ACG	2	6	488	493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144421
10	NC_017352	GAG	2	6	610	615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387144421
11	NC_017352	CTA	2	6	623	628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144421
12	NC_017352	TGT	2	6	637	642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144421
13	NC_017352	GAT	2	6	689	694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017352	AAAT	2	8	743	750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017352	TAA	2	6	786	791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017352	TAT	2	6	878	883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144422
17	NC_017352	A	6	6	1027	1032	100 %	0 %	0 %	0 %	387144422
18	NC_017352	CAT	2	6	1115	1120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144422
19	NC_017352	TA	3	6	1205	1210	50 %	50 %	0 %	0 %	387144422
20	NC_017352	TTG	2	6	1259	1264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144422
21	NC_017352	TACT	2	8	1282	1289	25 %	50 %	0 %	25 %	387144422
22	NC_017352	GGT	2	6	1315	1320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387144422
23	NC_017352	CCT	2	6	1369	1374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387144422
24	NC_017352	A	7	7	1437	1443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017352	ATG	2	6	1493	1498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144423
26	NC_017352	TA	3	6	1554	1559	50 %	50 %	0 %	0 %	387144423
27	NC_017352	TCTT	2	8	1623	1630	0 %	75 %	0 %	25 %	387144423
28	NC_017352	GTTTAA	2	12	1698	1709	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387144423
29	NC_017352	ATGT	2	8	1857	1864	25 %	50 %	25 %	0 %	387144423
30	NC_017352	TCA	2	6	1925	1930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144423
31	NC_017352	TAA	2	6	1943	1948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144423
32	NC_017352	T	6	6	1951	1956	0 %	100 %	0 %	0 %	387144423
33	NC_017352	TTC	2	6	1964	1969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144423
34	NC_017352	ATG	2	6	2023	2028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144423
35	NC_017352	AT	3	6	2061	2066	50 %	50 %	0 %	0 %	387144423
36	NC_017352	TAG	2	6	2093	2098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144423
37	NC_017352	AGA	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017352	TAA	2	6	2232	2237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017352	CTA	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017352	T	6	6	2367	2372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017352	CAA	2	6	2432	2437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017352	TGA	2	6	2447	2452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017352	CCT	2	6	2495	2500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017352	CT	3	6	2499	2504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017352	GA	3	6	2524	2529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017352	TAT	3	9	2540	2548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017352	GTC	2	6	2587	2592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017352	TA	3	6	2599	2604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017352	T	6	6	2611	2616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017352	AGA	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017352	ATC	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017352	A	6	6	2680	2685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017352	TAA	2	6	2691	2696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017352	AT	3	6	2774	2779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017352	TC	3	6	2814	2819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017352	ATT	2	6	2830	2835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017352	ATC	2	6	2857	2862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017352	TAC	2	6	2884	2889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017352	A	6	6	2904	2909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017352	A	7	7	2911	2917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017352	CTT	2	6	3007	3012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144424
62	NC_017352	TCTT	2	8	3089	3096	0 %	75 %	0 %	25 %	387144424
63	NC_017352	T	7	7	3102	3108	0 %	100 %	0 %	0 %	387144424
64	NC_017352	CCA	2	6	3163	3168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387144424
65	NC_017352	AAG	2	6	3176	3181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144424
66	NC_017352	ATT	2	6	3261	3266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144424
67	NC_017352	GAA	2	6	3277	3282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144424
68	NC_017352	CTT	2	6	3293	3298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144424
69	NC_017352	CAT	2	6	3314	3319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144424
70	NC_017352	TCA	2	6	3373	3378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387144424
71	NC_017352	AT	3	6	3400	3405	50 %	50 %	0 %	0 %	387144424
72	NC_017352	AAC	2	6	3459	3464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144424
73	NC_017352	GCA	2	6	3478	3483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387144424
74	NC_017352	ATA	2	6	3509	3514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144424
75	NC_017352	TAA	2	6	3545	3550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144424
76	NC_017352	A	7	7	3549	3555	100 %	0 %	0 %	0 %	387144424
77	NC_017352	TTC	2	6	3565	3570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387144424
78	NC_017352	TCC	2	6	3583	3588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017352	T	6	6	3606	3611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017352	ATT	2	6	3612	3617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017352	TA	3	6	3624	3629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017352	AATTA	2	10	3639	3648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017352	A	6	6	3654	3659	100 %	0 %	0 %	0 %	387144425
84	NC_017352	AAT	3	9	3710	3718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
85	NC_017352	T	6	6	3753	3758	0 %	100 %	0 %	0 %	387144425
86	NC_017352	ATA	2	6	3762	3767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
87	NC_017352	TAA	2	6	3808	3813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
88	NC_017352	ATA	2	6	3832	3837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
89	NC_017352	ATT	2	6	3863	3868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144425
90	NC_017352	ATTT	2	8	3890	3897	25 %	75 %	0 %	0 %	387144425
91	NC_017352	TAA	2	6	3947	3952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
92	NC_017352	TAT	2	6	3953	3958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144425
93	NC_017352	TAA	2	6	4003	4008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144425
94	NC_017352	ACA	2	6	4024	4029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387144425
95	NC_017352	TTTA	2	8	4082	4089	25 %	75 %	0 %	0 %	387144425
96	NC_017352	GAA	2	6	4116	4121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144425
97	NC_017352	A	6	6	4131	4136	100 %	0 %	0 %	0 %	387144425
98	NC_017352	A	7	7	4138	4144	100 %	0 %	0 %	0 %	387144425
99	NC_017352	A	7	7	4146	4152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017352	TC	3	6	4157	4162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017352	CCA	2	6	4231	4236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017352	GTG	2	6	4263	4268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017352	A	7	7	4299	4305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017352	T	6	6	4316	4321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017352	TACA	2	8	4355	4362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017352	TA	3	6	4387	4392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017352	CAT	2	6	4413	4418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017352	T	7	7	4428	4434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017352	AT	4	8	4454	4461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017352	T	9	9	4461	4469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017352	A	7	7	4528	4534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017352	A	6	6	4619	4624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017352	CGT	2	6	4627	4632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017352	ACCT	2	8	4682	4689	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017352	A	6	6	4692	4697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017352	ATTTTA	2	12	4713	4724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017352	T	6	6	4725	4730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017352	T	6	6	4738	4743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017352	TAA	2	6	4895	4900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017352	A	7	7	4907	4913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017352	T	6	6	4941	4946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017352	TCA	2	6	4960	4965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017352	AAC	2	6	4967	4972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017352	AAAT	2	8	4973	4980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017352	AAAT	2	8	4988	4995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017352	ACC	2	6	5007	5012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017352	GGT	2	6	5039	5044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017352	T	7	7	5067	5073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017352	TTC	3	9	5078	5086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017352	ATA	2	6	5135	5140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017352	A	6	6	5193	5198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017352	ATA	2	6	5223	5228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017352	CTAG	2	8	5240	5247	25 %	25 %	25 %	25 %	387144426
134	NC_017352	ATG	2	6	5249	5254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144426
135	NC_017352	GAA	2	6	5289	5294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387144426
136	NC_017352	TA	3	6	5310	5315	50 %	50 %	0 %	0 %	387144426
137	NC_017352	GAT	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387144426
138	NC_017352	ATT	2	6	5419	5424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387144426
139	NC_017352	TAA	2	6	5547	5552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144426
140	NC_017352	TAA	2	6	5559	5564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144426
141	NC_017352	ATAA	2	8	5643	5650	75 %	25 %	0 %	0 %	387144426
142	NC_017352	TAA	2	6	5699	5704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387144426
143	NC_017352	GCTT	2	8	5705	5712	0 %	50 %	25 %	25 %	387144426
144	NC_017352	T	8	8	5714	5721	0 %	100 %	0 %	0 %	387144426
145	NC_017352	TTG	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387144426
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482	NC_017352	TTACT	2	10	17921	17930	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
483	NC_017352	AT	3	6	17933	17938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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